Het principe van de micropomp kan worden onderverdeeld in verschillende belangrijke onderdelen. Om het principe duidelijk te beschrijven, volgt hier een gedetailleerde uitleg:
Zelf-aanzuigend principe:
De micropomp kan water opnemen zonder het water af te voeren, wat betekent dat deze een zelf-aanzuigende functie heeft.
Wanneer de pompleiding van de pomp lucht is, wordt de negatieve druk (vacuüm) gebruikt die ontstaat wanneer de pomp werkt, en wordt de waterdruk onder de pomppoort verhoogd onder invloed van de atmosferische druk, waarna het water via het afvoeruiteinde van de pomp wordt afgevoerd.
Het is de moeite waard om op te merken dat hoewel sommige micropompen ook een zelf-aanzuigende capaciteit hebben, hun maximale zelf-aanzuigende hoogte mogelijk alleen verwijst naar de hoogte van het water dat kan worden opgepompt "nadat er water is toegevoegd", en niet naar de werkelijke betekenis van zelf-aanzuigend.